23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1397 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  100 
 
 		 304 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  62.25 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0433  hypothetical protein  42.03 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.233515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  22.8 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1059 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.69 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7035  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.85 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  37.31 
 
 		 1746 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  23.71 
 
 		 1597 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4907  hypothetical protein  26.67 
 
 		 825 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000428379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  27.23 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0638  hypothetical protein  31.15 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15480  hypothetical protein  38.16 
 
 		 508 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.857136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  22.61 
 
 		 1708 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  26.07 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  30.05 
 
 		 561 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2758  hypothetical protein  24.56 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00648558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  23.14 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  21.15 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.84 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  27.57 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2296  hypothetical protein  25.15 
 
 		 353 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  22.86 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>