57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5274 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
367 aa  737    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  42.74 
 
 
364 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  42.55 
 
 
374 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  41.03 
 
 
382 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  34.88 
 
 
345 aa  173  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  35.83 
 
 
323 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  33.97 
 
 
328 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  33.87 
 
 
342 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  36.97 
 
 
328 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  30.95 
 
 
724 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  27.74 
 
 
294 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  30.47 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  26.63 
 
 
302 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  28.31 
 
 
297 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  30.32 
 
 
343 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  28.31 
 
 
296 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  28.61 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  28.96 
 
 
296 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  28.66 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  27.43 
 
 
320 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  26.3 
 
 
561 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  27.54 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  25.68 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  26.73 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  24.11 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  27.74 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  29.55 
 
 
343 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  25.36 
 
 
1178 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  24.26 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  24.26 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  24.26 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  25.25 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  23.26 
 
 
332 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  24.68 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  23.81 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  25 
 
 
318 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  26 
 
 
349 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  33.64 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  24.64 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  27.53 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  23.32 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  27.66 
 
 
506 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  27.65 
 
 
494 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  21.33 
 
 
336 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  33.98 
 
 
491 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  23.21 
 
 
332 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  21.18 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  26.04 
 
 
714 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  23.55 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  24.25 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  21.82 
 
 
326 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  22.55 
 
 
331 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  25 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  21.99 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  25.16 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  23.38 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  24.27 
 
 
496 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>