79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3176 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  100 
 
 		 382 aa  787    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  62.02 
 
 		 374 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  47.99 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  41.03 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  41.32 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  37.65 
 
 		 323 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  34.09 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  36.39 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  33.04 
 
 		 342 aa  146  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  33.54 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  30.84 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  29.28 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  30.49 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  30.49 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  30.24 
 
 		 332 aa  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  27.11 
 
 		 724 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  30.84 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  28.69 
 
 		 1178 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  29.23 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  27.58 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  30.53 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  25.87 
 
 		 561 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  28.97 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  30.12 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  29.47 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  27.12 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  28.12 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  26.65 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  26.86 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  27.6 
 
 		 355 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  27.53 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  26.35 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  26.35 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  26.35 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  26.33 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  26.84 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  25.5 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  28.89 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  29.8 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  27.03 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  25.29 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  27.44 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  26.24 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  27.19 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  27.6 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  25.53 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  27.45 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  25.33 
 
 		 714 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  26.23 
 
 		 494 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  28.71 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  28.4 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  25.65 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  26.42 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  28.4 
 
 		 433 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  23.91 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  24.9 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  23.96 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  28.52 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  27.78 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  25.16 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  25.5 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  25.7 
 
 		 488 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  22.78 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  24.78 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  25.79 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  25.71 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  25.82 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  25.09 
 
 		 481 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  21.88 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  23.28 
 
 		 332 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  28.57 
 
 		 506 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  21.64 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  26.24 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  23.55 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0696  hypothetical protein  44 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  0.0673528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  24.69 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  23.58 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  23.3 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  22.62 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>