83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2271 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 
323 aa  657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  80.19 
 
 
345 aa  538  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  40.63 
 
 
328 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  37.65 
 
 
382 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  35.94 
 
 
374 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  37.9 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  39.01 
 
 
342 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  38.56 
 
 
328 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  35.83 
 
 
367 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  36.05 
 
 
296 aa  165  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  35.37 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  32.78 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  32.46 
 
 
296 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  31.29 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  29.02 
 
 
302 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  31.01 
 
 
1178 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  29.18 
 
 
724 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  30.7 
 
 
343 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  30.55 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  29.13 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  29 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  29 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  29 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  30 
 
 
354 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  32.48 
 
 
318 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  28.57 
 
 
332 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  32.8 
 
 
329 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  30.77 
 
 
349 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  27.44 
 
 
359 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  31 
 
 
317 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  28.35 
 
 
352 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  28.53 
 
 
320 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  30 
 
 
343 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  28.75 
 
 
320 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  28.92 
 
 
561 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  26.92 
 
 
355 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  29.52 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  29.04 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  27.58 
 
 
363 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  26.44 
 
 
355 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  27.87 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  27.7 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  25.94 
 
 
714 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  26.84 
 
 
329 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  27.03 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  28.21 
 
 
433 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  28.36 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  25.39 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  25.16 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  25.93 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  26.27 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  22.58 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  24.7 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  26.84 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  24.92 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  29.96 
 
 
496 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  24.04 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  31.39 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  27.62 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  25.24 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  25.63 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  28.57 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  27.86 
 
 
496 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  23.89 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  28.86 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  25.66 
 
 
490 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  27.69 
 
 
440 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  25.23 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  27.76 
 
 
481 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  30.56 
 
 
506 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  29.3 
 
 
430 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  22.15 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  24.45 
 
 
340 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  29.8 
 
 
494 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  27.97 
 
 
492 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  25.45 
 
 
400 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 
675 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  23.74 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  28.69 
 
 
489 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  31.71 
 
 
456 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  34.12 
 
 
350 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2296  hypothetical protein  40.43 
 
 
353 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  30.83 
 
 
480 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>