86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3374 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  100 
 
 		 494 aa  981    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  53.88 
 
 		 506 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  47.51 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  47.2 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  46.38 
 
 		 491 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  41.65 
 
 		 490 aa  359  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  39.26 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  42.13 
 
 		 489 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  39.22 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  40.57 
 
 		 496 aa  352  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  38.83 
 
 		 492 aa  342  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  39.92 
 
 		 490 aa  336  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  38.24 
 
 		 433 aa  296  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  36.78 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  47.39 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  47.28 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  46.64 
 
 		 433 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  35.71 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  31 
 
 		 294 aa  123  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  33.92 
 
 		 296 aa  123  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  32.16 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  35.68 
 
 		 724 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  36.21 
 
 		 354 aa  113  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  33.92 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  33.48 
 
 		 296 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  33.73 
 
 		 357 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  33.05 
 
 		 296 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  28.48 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  39.29 
 
 		 180 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  30.11 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  30.11 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  30.11 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  30.74 
 
 		 352 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  37.61 
 
 		 329 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  27.59 
 
 		 355 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  33.76 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  29.54 
 
 		 1178 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  31.71 
 
 		 343 aa  97.4  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  34.89 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  27.51 
 
 		 355 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  29.15 
 
 		 332 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  30 
 
 		 352 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  33.77 
 
 		 328 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  33.85 
 
 		 326 aa  90.9  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  33.85 
 
 		 326 aa  90.1  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  30.33 
 
 		 373 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  34.81 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  30.43 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  30.34 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  32.17 
 
 		 317 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  33.04 
 
 		 320 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  28.98 
 
 		 340 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  32.35 
 
 		 338 aa  79.7  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  30.37 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  28.81 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  31.88 
 
 		 714 aa  76.6  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  31.95 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  30.95 
 
 		 312 aa  76.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  29.68 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  30.73 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  30 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  29.82 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  37.61 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  29.45 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  37.5 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  26.32 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  29.63 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  30 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  30.23 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  27.98 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  29.34 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  27.84 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  27.01 
 
 		 379 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  23.47 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  29.67 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  35.14 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  33.96 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  27.92 
 
 		 342 aa  54.7  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  33.6 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  29.8 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  27.65 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2570  hypothetical protein  39.36 
 
 		 307 aa  52  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  32.38 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  26.98 
 
 		 343 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  24.69 
 
 		 364 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  27.93 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>