87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1722 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
355 aa  728    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  72.21 
 
 
352 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  47.98 
 
 
352 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  46.88 
 
 
355 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  47.38 
 
 
354 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  46.97 
 
 
349 aa  301  9e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  43.6 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  43.6 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  43.6 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  44.48 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  43.7 
 
 
316 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  40.86 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  40.16 
 
 
296 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  33.52 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  38.4 
 
 
297 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  38.77 
 
 
329 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  33.99 
 
 
330 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  37.7 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  38.46 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  38.46 
 
 
296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  39.15 
 
 
302 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  38.67 
 
 
318 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  37 
 
 
344 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  34.94 
 
 
320 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  38.61 
 
 
326 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  39 
 
 
326 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  35.77 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  36.09 
 
 
319 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  48.72 
 
 
180 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  37.25 
 
 
338 aa  142  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  38.89 
 
 
336 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  35 
 
 
724 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  33.09 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  37.5 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  37.61 
 
 
312 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  35 
 
 
1178 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  30.47 
 
 
328 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  33.58 
 
 
328 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  38.14 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  34.59 
 
 
329 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  37.67 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  29.17 
 
 
332 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  31.14 
 
 
359 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  35.34 
 
 
331 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  31.92 
 
 
340 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  31.84 
 
 
332 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  33.71 
 
 
496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  31.82 
 
 
437 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  32.62 
 
 
481 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  34.21 
 
 
433 aa  112  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  34.76 
 
 
492 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  36.24 
 
 
489 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  32.48 
 
 
430 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  31.6 
 
 
490 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  33.64 
 
 
433 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  30.56 
 
 
379 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  31.53 
 
 
491 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  31.74 
 
 
440 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  29.78 
 
 
496 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  28.07 
 
 
343 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  41.8 
 
 
714 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  31.48 
 
 
488 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  32.03 
 
 
505 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  30.9 
 
 
490 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  30.18 
 
 
506 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  27.47 
 
 
494 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  27.54 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  26.44 
 
 
323 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  26.44 
 
 
345 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  28.69 
 
 
373 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  27.11 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  27.78 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  27.6 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  33.19 
 
 
385 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  22.8 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  26.42 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  26.22 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  26.78 
 
 
396 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  27.89 
 
 
370 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  29.9 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  24.23 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  24.55 
 
 
393 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  24.92 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  25.93 
 
 
400 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  24.65 
 
 
342 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  25.15 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  23.38 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>