89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3362 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 
352 aa  721    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  61.08 
 
 
355 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  55.33 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  55.87 
 
 
349 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  50.43 
 
 
351 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  50.43 
 
 
351 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  50.43 
 
 
351 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  47.98 
 
 
355 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  45.82 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  44.79 
 
 
357 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  38.1 
 
 
316 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  44.08 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  35.28 
 
 
302 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  39.92 
 
 
296 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  38.71 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  39 
 
 
320 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  42.51 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  42.51 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  34.07 
 
 
329 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  40 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  31.18 
 
 
319 aa  169  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  37.73 
 
 
343 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  36.58 
 
 
318 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  35.67 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  37.97 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  39.13 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  31.93 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  30.47 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  34.58 
 
 
336 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  38.15 
 
 
338 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  34.81 
 
 
724 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  37.1 
 
 
312 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  38.1 
 
 
1178 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  43.37 
 
 
180 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  35.97 
 
 
318 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  33.21 
 
 
340 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  36.61 
 
 
331 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  35.89 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  33.98 
 
 
329 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  35.08 
 
 
321 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  34.39 
 
 
328 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  30.95 
 
 
332 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  31.4 
 
 
340 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  34.78 
 
 
433 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  28.03 
 
 
328 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  32.89 
 
 
491 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  33.04 
 
 
496 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  32.05 
 
 
496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  34.45 
 
 
492 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  34.91 
 
 
489 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  32.76 
 
 
488 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  28.69 
 
 
328 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  29.82 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  30.9 
 
 
433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  32.36 
 
 
379 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  33.49 
 
 
481 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  28.66 
 
 
359 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  30.9 
 
 
506 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  31.21 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  31.85 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  32.02 
 
 
490 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  32.31 
 
 
353 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  31.06 
 
 
363 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  31 
 
 
440 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  28.35 
 
 
323 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  31.84 
 
 
714 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  31.6 
 
 
505 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  30.43 
 
 
430 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  31.47 
 
 
490 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  26.92 
 
 
345 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  31.47 
 
 
494 aa  95.9  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  28.04 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  29.63 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  29.41 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.8 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  27.44 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  26.8 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  27.47 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  27.44 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  26.69 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  28.49 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  28.01 
 
 
425 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  25.25 
 
 
367 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  25.36 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  25.91 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  25.91 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  22.97 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0696  hypothetical protein  21.43 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  0.0673528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  22.73 
 
 
561 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>