70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6158 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  100 
 
 		 374 aa  779    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  62.02 
 
 		 382 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  45.13 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  42.55 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  36.73 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  35.94 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  40.13 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  34.82 
 
 		 328 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  31.23 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  30.28 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  31.8 
 
 		 296 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  31.5 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  29.97 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  29.02 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  26.92 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  29.39 
 
 		 1178 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  25.48 
 
 		 561 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  29.08 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  27.46 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  29.06 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  27.46 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  27.66 
 
 		 724 aa  89.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  27.16 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  28.61 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  28.34 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  27.88 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  26.18 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  25.82 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  26.54 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  27.33 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  26.63 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  26.82 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  24.57 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  27.82 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  22.8 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  24.19 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  24.35 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  27.47 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  28.73 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  26.18 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  27.35 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  25.08 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  26 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  22.68 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  22.68 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  22.68 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  23.64 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  26.54 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  23.86 
 
 		 481 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  23.47 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  25.41 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  23.24 
 
 		 329 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  30 
 
 		 488 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  23.08 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  23.47 
 
 		 326 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  24.28 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  23.19 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  25.51 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  29.25 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  21.4 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  33.03 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  26.48 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  22.26 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  22.7 
 
 		 714 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  28.23 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  28.46 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  21.33 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  25.41 
 
 		 506 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  21.74 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  27.14 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>