88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1530 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  100 
 
 		 351 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  99.72 
 
 		 351 aa  729    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  50.43 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  49.57 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  49.56 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  48.15 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  45.76 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  43.6 
 
 		 355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  41.26 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  49.22 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  43.5 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  38.98 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  41.11 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  43.09 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  43.09 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  39.06 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  40.08 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  37.16 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  39.69 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  35.63 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  39.69 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  37.73 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  41.08 
 
 		 326 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  38.49 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  36.96 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  39.02 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  38.68 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  40.25 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  37.39 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  39 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  35.85 
 
 		 724 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  43.2 
 
 		 180 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  39.18 
 
 		 1178 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  37.34 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  36.33 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  34.82 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  36.69 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  38.03 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  36.44 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  37.61 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  33.59 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  34.13 
 
 		 496 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  32.75 
 
 		 433 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  34.65 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  34.78 
 
 		 489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  31.6 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  36.82 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  28.87 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  32.19 
 
 		 437 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  33.33 
 
 		 491 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  33.48 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  33.58 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  31.65 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  34.78 
 
 		 492 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  34.68 
 
 		 490 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  33.19 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  30.56 
 
 		 490 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  27.25 
 
 		 714 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  29 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  33.33 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  32.83 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  32.19 
 
 		 488 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  30.23 
 
 		 494 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  32.05 
 
 		 506 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  28.76 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  29.44 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  32.19 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  32.58 
 
 		 376 aa  99.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  31.35 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  26.54 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  32.58 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  29.06 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  26.35 
 
 		 382 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  26.32 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  27.56 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  25.86 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  28.31 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  29.7 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  27.24 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  24.26 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  22.68 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  24.72 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  28.49 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  24.37 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  25.58 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  41.67 
 
 		 561 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>