85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2264 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
340 aa  703    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  61.66 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  61.68 
 
 
326 aa  431  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  59.88 
 
 
336 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  52.58 
 
 
331 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  53.23 
 
 
329 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  52.96 
 
 
328 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  54.09 
 
 
318 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  51.99 
 
 
332 aa  362  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  52.52 
 
 
338 aa  349  5e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  50.8 
 
 
312 aa  335  5e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  47.98 
 
 
321 aa  329  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  38.39 
 
 
316 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  35.18 
 
 
330 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  36.89 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  33.99 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  33 
 
 
317 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  32.01 
 
 
319 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  32.01 
 
 
320 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  31.02 
 
 
318 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  34.11 
 
 
355 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  30.83 
 
 
354 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  34.88 
 
 
349 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  34.82 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  34.82 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  34.82 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  34.77 
 
 
352 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  33.21 
 
 
352 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  32.25 
 
 
340 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  36.49 
 
 
357 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  33.77 
 
 
294 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  33.09 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  30.61 
 
 
296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  34.44 
 
 
724 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  33.09 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  31.44 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  32.46 
 
 
296 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  32.13 
 
 
296 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  28.43 
 
 
297 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  32.65 
 
 
1178 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  31.51 
 
 
396 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  30.89 
 
 
332 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  30.63 
 
 
359 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  27.74 
 
 
328 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  36.6 
 
 
180 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  26.77 
 
 
395 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  31.39 
 
 
437 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  30.89 
 
 
363 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  36.36 
 
 
491 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  34.02 
 
 
496 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  40.3 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  30.8 
 
 
496 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  28.38 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  33.98 
 
 
430 aa  92.8  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  27.38 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  30.82 
 
 
373 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  40 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  25.99 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  31.11 
 
 
433 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  30.96 
 
 
440 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  29.46 
 
 
433 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  38.84 
 
 
714 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  26.91 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  37.4 
 
 
373 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  26.46 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  31.7 
 
 
489 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  29.82 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  31.58 
 
 
481 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  25.61 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  31.4 
 
 
506 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  31.55 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  28.57 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.36 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  29.38 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  29.49 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  29.81 
 
 
494 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  31.96 
 
 
505 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  26.27 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  23.67 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  23.93 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  27.35 
 
 
370 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  23.18 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  25.82 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  25.48 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>