79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3324 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  100 
 
 		 505 aa  1031    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  50.62 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  49.18 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  46.96 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  47.98 
 
 		 494 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  43.44 
 
 		 490 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  40.94 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  42.98 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  39.75 
 
 		 496 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  39.84 
 
 		 490 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  38.4 
 
 		 488 aa  350  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  39.17 
 
 		 481 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  38.28 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  46.38 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  44.68 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  45.3 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  44.78 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  34.93 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  30.74 
 
 		 355 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  34.8 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  34.8 
 
 		 296 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  33.47 
 
 		 343 aa  106  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  34.8 
 
 		 354 aa  106  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  32.88 
 
 		 302 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  31.53 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  31.6 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  33.03 
 
 		 297 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  32.19 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  33.91 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  32.19 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  32.19 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  30.48 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  37.59 
 
 		 180 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  34.44 
 
 		 316 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  33.69 
 
 		 329 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  31.15 
 
 		 724 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  33.78 
 
 		 352 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  28.45 
 
 		 1178 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  32.03 
 
 		 355 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  32.08 
 
 		 330 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  34.58 
 
 		 317 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  32.19 
 
 		 320 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  24.56 
 
 		 359 aa  87  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  31.91 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  29.84 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  34.57 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  32.92 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  35.63 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  32.02 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  32.12 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  32.12 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  33.33 
 
 		 321 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  31.22 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  31.77 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  30.77 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  34.05 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  28.81 
 
 		 714 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  31.96 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  32.78 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  31.96 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  31.77 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  31.43 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  29.83 
 
 		 370 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  34.88 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  30.73 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  29.15 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  30.65 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  30.89 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  33.33 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  26.16 
 
 		 328 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  28.19 
 
 		 340 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2570  hypothetical protein  41.89 
 
 		 307 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  24.74 
 
 		 425 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  32.08 
 
 		 395 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  31.4 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  32.35 
 
 		 396 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  32.69 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  34.91 
 
 		 393 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>