79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3003 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  100 
 
 		 396 aa  823    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  65.3 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  62.76 
 
 		 395 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  63.14 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  60.52 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  59.95 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  56.04 
 
 		 425 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  33.33 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  31.91 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  32.35 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  31.46 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  32.78 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  31.46 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  30.49 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  28.76 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  29.34 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  32.38 
 
 		 340 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  28.34 
 
 		 320 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  27.72 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  29.66 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  28.78 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  29.39 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  29.39 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  29.05 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  33.84 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  29.41 
 
 		 336 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  32.52 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  33.79 
 
 		 338 aa  93.6  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  25.57 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  26.64 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  29.66 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  25.51 
 
 		 1178 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  27.94 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  28.52 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  29.19 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  25.25 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  25.25 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  25.99 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  28.74 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  29.72 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  26.37 
 
 		 714 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  25.83 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  27.37 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  26.69 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  26.14 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  35.71 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  32.97 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  26.93 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  29.04 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  29.04 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  25.23 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  29.04 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  27.87 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  27.87 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  27.34 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  26.28 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  30.73 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  26.82 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  29.51 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  26.17 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  29.03 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  28.31 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  28.49 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  27.84 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  22.68 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  25 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  25.98 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  24.23 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  21.55 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  25.34 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  32.61 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  24.61 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  32.31 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  26.15 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  26.19 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  25.83 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  29.75 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  30.51 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  24.5 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>