21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0103 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
350 aa  704    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  44.65 
 
 
334 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  44.65 
 
 
334 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1153  glycosidase, PH1107-related  46.38 
 
 
353 aa  261  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0153392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  26.69 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  25.62 
 
 
316 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  26.35 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  26.45 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  27.4 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  24.25 
 
 
294 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  25.86 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  25.47 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  25.13 
 
 
373 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  26.25 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  22.55 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  23.56 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  24.69 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  26.82 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  34.12 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  24.62 
 
 
490 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  22.58 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>