43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1589 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1540  glycosyl transferase family protein  93.42 
 
 
380 aa  736    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0303814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1589  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
380 aa  776    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0747672  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0071  glycosyl transferase family protein  54.26 
 
 
393 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0186  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 
404 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236135  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5025  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2964  hypothetical protein  24.69 
 
 
410 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.931605  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2999  hypothetical protein  26.99 
 
 
407 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3098  hypothetical protein  25.25 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3199  hypothetical protein  26.54 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  22.36 
 
 
1178 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.35 
 
 
324 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.4 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.69 
 
 
319 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
206 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
213 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1138  hypothetical protein  26.21 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.32 
 
 
334 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 
510 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
359 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
226 aa  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.8 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
228 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  33.33 
 
 
260 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
340 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
227 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.45 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.45 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.45 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  27.04 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
229 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
293 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
253 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  24.8 
 
 
430 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.35 
 
 
220 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
228 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
229 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.89 
 
 
312 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>