63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2244 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  870    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  86.35 
 
 
430 aa  750    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  65.82 
 
 
395 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  65.82 
 
 
395 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  65.66 
 
 
408 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  65.5 
 
 
408 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  65.25 
 
 
408 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  65.4 
 
 
402 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  63.89 
 
 
408 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  39.04 
 
 
404 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  36.03 
 
 
409 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  36.23 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  35.8 
 
 
406 aa  232  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  35.98 
 
 
409 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  35.06 
 
 
405 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  34.9 
 
 
404 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.41 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.41 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.41 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  35.38 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.24 
 
 
407 aa  217  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  34.41 
 
 
406 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  33.74 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  34.07 
 
 
416 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.39 
 
 
409 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  32.76 
 
 
409 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  33.25 
 
 
408 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  32.1 
 
 
403 aa  205  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2502  putative glycosyltransferase  31.78 
 
 
403 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0127877  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  32.58 
 
 
365 aa  169  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  31.62 
 
 
448 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  32.74 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  32.38 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  32.58 
 
 
373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  35.1 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.5 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.33 
 
 
343 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.49 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.33 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.77 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.98 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.33 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.65 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.39 
 
 
342 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.51 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.65 
 
 
335 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.1 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.1 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.1 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.05 
 
 
325 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
510 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 
330 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.17 
 
 
315 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.69 
 
 
312 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0071  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1589  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
380 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0747672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>