More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8126 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 
342 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  58.26 
 
 
335 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  57.19 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.45 
 
 
334 aa  326  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  50.61 
 
 
326 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  53.82 
 
 
343 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  53.25 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.6 
 
 
318 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  56.6 
 
 
320 aa  299  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.56 
 
 
315 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  55.9 
 
 
324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.09 
 
 
325 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  48.73 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  50.31 
 
 
312 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.03 
 
 
325 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  49.63 
 
 
299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.08 
 
 
319 aa  245  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  49.52 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.74 
 
 
335 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.6 
 
 
334 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.6 
 
 
334 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.6 
 
 
334 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  46.39 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  42.95 
 
 
316 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.66 
 
 
324 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  47.7 
 
 
302 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
510 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
522 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  31.46 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  31.46 
 
 
395 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  32.77 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.13 
 
 
410 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  33.52 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  30.11 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  29.55 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  29.55 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  32.39 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  26.15 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  29.55 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
206 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  22.44 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  31.69 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
231 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  25.26 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  25.97 
 
 
410 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
209 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.84 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
221 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  24.87 
 
 
406 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.18 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  32.7 
 
 
397 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  22.06 
 
 
407 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
241 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.14 
 
 
407 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.14 
 
 
407 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.14 
 
 
407 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
285 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  25.12 
 
 
416 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
230 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  31.74 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  28.83 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0375  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.293513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  27.55 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
273 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
410 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  27.08 
 
 
405 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  27.5 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  26.53 
 
 
409 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
394 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  31.18 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  23.85 
 
 
408 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.84 
 
 
382 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  24.07 
 
 
403 aa  56.2  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  34.51 
 
 
693 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.66 
 
 
236 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  28.43 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  24.72 
 
 
404 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
346 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
365 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  43.43 
 
 
123 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>