More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0167 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 
315 aa  620  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.95 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  55 
 
 
335 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.56 
 
 
342 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  51.45 
 
 
326 aa  289  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  54.86 
 
 
330 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.55 
 
 
343 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  51.32 
 
 
359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  52.55 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.85 
 
 
312 aa  272  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.81 
 
 
318 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  53.8 
 
 
324 aa  268  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  51.67 
 
 
319 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  52.82 
 
 
319 aa  265  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  52.17 
 
 
316 aa  262  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  56.59 
 
 
320 aa  261  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  45.57 
 
 
325 aa  258  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  49.68 
 
 
324 aa  258  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  51.33 
 
 
334 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  51.33 
 
 
334 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  53.76 
 
 
299 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  51.33 
 
 
334 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.14 
 
 
325 aa  235  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.27 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  49.31 
 
 
302 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  45.16 
 
 
329 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
510 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
522 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  28.01 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
236 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  28.01 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.44 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  25.94 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  29.37 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  31.72 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  28.83 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  31.5 
 
 
408 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  30.49 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.94 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  28.11 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  26.02 
 
 
408 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  26.87 
 
 
406 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  29.17 
 
 
425 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.81 
 
 
407 aa  62.8  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  41.28 
 
 
259 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
222 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.28 
 
 
409 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  29.41 
 
 
404 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  32.39 
 
 
693 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
241 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  32.4 
 
 
430 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  24.41 
 
 
405 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  32.95 
 
 
363 aa  59.3  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
640 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  33.97 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1868  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
503 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.790321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.44 
 
 
410 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  24.63 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2760  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 
796 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0289514  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3020  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 
793 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2811  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 
512 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0330825  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
378 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3022  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.03 
 
 
773 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  22.45 
 
 
404 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
234 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.35 
 
 
407 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.35 
 
 
407 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.35 
 
 
407 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 
386 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  28.8 
 
 
409 aa  55.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  28.71 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  27.72 
 
 
408 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2743  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.62 
 
 
796 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.35 
 
 
528 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  29.57 
 
 
238 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>