More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0256 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 317 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  65.89 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  65.79 
 
 		 332 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  63.16 
 
 		 346 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  61.92 
 
 		 327 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  59.22 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  61.07 
 
 		 332 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  57.76 
 
 		 330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  63.26 
 
 		 321 aa  350  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  59.54 
 
 		 318 aa  348  7e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  59.8 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  64.78 
 
 		 330 aa  335  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  60.53 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  52.92 
 
 		 346 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  53.97 
 
 		 335 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  52.98 
 
 		 335 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  55.63 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  55.63 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  52.29 
 
 		 334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  48.86 
 
 		 307 aa  292  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  46.96 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  48.12 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  47.08 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  43.62 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  48.33 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  44.9 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.58 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  32.75 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 394 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 		 221 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 231 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 287 aa  99.4  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 229 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.49 
 
 		 382 aa  95.9  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32.14 
 
 		 410 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  25.17 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 340 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 226 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 480 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 227 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  32.14 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 		 410 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 414 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 412 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 559 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  30.26 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 230 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 371 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>