More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3061 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 480 aa  943    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  85.9 
 
 		 559 aa  614  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  51.2 
 
 		 394 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  44.33 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  40.7 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  41.98 
 
 		 382 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  44.03 
 
 		 412 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  45.95 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  45.89 
 
 		 430 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  44.03 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  42.16 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5467  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 		 418 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 221 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 303 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  39.38 
 
 		 273 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 231 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 304 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 310 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 		 259 aa  116  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.48 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 355 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 312 aa  109  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 305 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  33.03 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  37.67 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 329 aa  108  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  28.34 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 315 aa  106  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 		 272 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  36.49 
 
 		 276 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 332 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.59 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  37.02 
 
 		 694 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  37.39 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 314 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 		 253 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 		 224 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  36.44 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 234 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 318 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  34.7 
 
 		 313 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 		 301 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  32.49 
 
 		 314 aa  101  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 229 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 321 aa  100  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 308 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 314 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  34.51 
 
 		 334 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 238 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  31.06 
 
 		 322 aa  98.2  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 		 217 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 319 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 344 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 		 266 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 346 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 298 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 238 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 		 287 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 272 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 253 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 257 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 257 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 327 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 242 aa  94.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 283 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 305 aa  94.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 227 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 335 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 685 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 		 385 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 		 302 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 307 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 227 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 293 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 318 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 229 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 285 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 357 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 336 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.92 
 
 		 299 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 227 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>