More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0660 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
414 aa  840    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  49.48 
 
 
412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  47.77 
 
 
406 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  46.97 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  45.48 
 
 
430 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  42.82 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 
559 aa  269  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  45.09 
 
 
480 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  38.76 
 
 
382 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
394 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
378 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
374 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  37.03 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5467  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
418 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66803  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
298 aa  124  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
273 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.8 
 
 
310 aa  109  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
303 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  35.68 
 
 
410 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
304 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
308 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
330 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  34.84 
 
 
410 aa  106  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.2 
 
 
299 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
448 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
312 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
310 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
307 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
313 aa  103  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  29.49 
 
 
317 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
420 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.77 
 
 
410 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
414 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
321 aa  100  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
411 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
231 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
329 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 
259 aa  99.8  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
283 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
262 aa  99.8  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
272 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
606 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
266 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
332 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
346 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  31.8 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
217 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  30.4 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
694 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
318 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
318 aa  93.6  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
291 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  27.76 
 
 
309 aa  92.8  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
327 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
332 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
613 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  28.17 
 
 
259 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
245 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
336 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
325 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
324 aa  90.1  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
305 aa  89.7  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  31.11 
 
 
276 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  34.08 
 
 
285 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
271 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
285 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
314 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
271 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.54 
 
 
305 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
236 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
257 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  27.34 
 
 
322 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
317 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
273 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
234 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
287 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
295 aa  87  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
238 aa  86.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
238 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  28.27 
 
 
314 aa  86.7  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
250 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  26.19 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
239 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 
319 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
685 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.32 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>