More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0148 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  100 
 
 		 334 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  76.59 
 
 		 335 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  72.17 
 
 		 335 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  52.81 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  50.98 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  51.67 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  51.66 
 
 		 313 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  50.65 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  52.29 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  50.17 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  47.3 
 
 		 332 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  50.34 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  50.34 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  44.69 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  49.34 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  49.34 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  49.16 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  47.47 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  52.17 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  45.48 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  48.67 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  48.32 
 
 		 318 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  45.49 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  45.35 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  38.51 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  42.38 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  35.86 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  36.16 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 		 394 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 272 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 283 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 266 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32.41 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 229 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  32.24 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 559 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.47 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 531 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 527 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 519 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.73 
 
 		 809 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  29.55 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>