More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1189 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  100 
 
 		 310 aa  640    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  77.78 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  56.01 
 
 		 307 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  53.9 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  54.67 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  50.16 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  46.39 
 
 		 346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  45.39 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  47.12 
 
 		 327 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  46.05 
 
 		 313 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  44.67 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  43.73 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  43.69 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  48.23 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  44.95 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  45.49 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  46.77 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  42.81 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  41.89 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  45.36 
 
 		 314 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  45.36 
 
 		 314 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  45.1 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  48.14 
 
 		 330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  35 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  31.77 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 		 394 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 420 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30.45 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 394 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 414 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30 
 
 		 382 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  29.78 
 
 		 276 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  26.19 
 
 		 406 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 250 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  28.77 
 
 		 410 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 221 aa  96.3  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.62 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  29.88 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 430 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 412 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 355 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  24.75 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 226 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  30.22 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 480 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 389 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  25.24 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 226 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>