More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5439 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
318 aa  658    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  51.49 
 
 
307 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  48.24 
 
 
314 aa  298  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  44.3 
 
 
324 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  45.85 
 
 
310 aa  277  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  45.51 
 
 
314 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 
346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  40.45 
 
 
335 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 
335 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
332 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  38.73 
 
 
327 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 
346 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
332 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
317 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  39.8 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  38.51 
 
 
334 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  37.78 
 
 
317 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  34.54 
 
 
322 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
318 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  42.08 
 
 
321 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
303 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  38.72 
 
 
330 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
312 aa  169  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
310 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  32.32 
 
 
309 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
307 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
308 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
315 aa  143  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.13 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
308 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
336 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
305 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
448 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
394 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
298 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.6 
 
 
382 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
411 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
414 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
420 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
253 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
355 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
378 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
227 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
394 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
227 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29 
 
 
410 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
227 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.76 
 
 
410 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
480 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  26.75 
 
 
435 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  29 
 
 
410 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
531 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
385 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
221 aa  86.3  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
230 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
519 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
244 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
232 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  29.74 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
527 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
527 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  23.23 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>