More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0214 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
378 aa  756    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
394 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  51.07 
 
 
382 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  48.53 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  43.05 
 
 
394 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  39.69 
 
 
412 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 
559 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  45.99 
 
 
480 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  37.27 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
414 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  41.43 
 
 
412 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5467  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66803  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
221 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
231 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  39.73 
 
 
259 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
304 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
234 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
303 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
307 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.47 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
308 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  36.04 
 
 
410 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
324 aa  106  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.05 
 
 
305 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
287 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  29.41 
 
 
309 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
250 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
346 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
305 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  31.89 
 
 
314 aa  103  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
317 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 
253 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
236 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
230 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
355 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
262 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
229 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
302 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
227 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
295 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
310 aa  99.8  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
230 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.84 
 
 
410 aa  99  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
285 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  35.29 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
227 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
321 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
332 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
227 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
227 aa  96.3  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  34.22 
 
 
276 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
236 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  31.76 
 
 
238 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
226 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
272 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
249 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
319 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
319 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
332 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  30.23 
 
 
231 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  33.49 
 
 
299 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
336 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
282 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 
285 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
273 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
284 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
321 aa  90.1  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
251 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 
242 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
364 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
344 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
308 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
389 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
261 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
218 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  30.6 
 
 
322 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
262 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
315 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  27.02 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  28.78 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>