More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1737 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
312 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  46.49 
 
 
332 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 
346 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  43.73 
 
 
313 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  43.81 
 
 
327 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  44.19 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
330 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
317 aa  242  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
307 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  42.03 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  41.64 
 
 
322 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  40.74 
 
 
310 aa  236  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  43.26 
 
 
335 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  43.42 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 
321 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  43.46 
 
 
314 aa  228  9e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  44.15 
 
 
314 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  44.15 
 
 
314 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  42.86 
 
 
334 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  42.18 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  39.94 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
324 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  43.07 
 
 
314 aa  216  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 
318 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  40.55 
 
 
310 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  43.24 
 
 
330 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
318 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
303 aa  139  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  32.7 
 
 
305 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
315 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.39 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
308 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
394 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
291 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
374 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
394 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
307 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
298 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
273 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
329 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
371 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
305 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
310 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
295 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
414 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
336 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.86 
 
 
382 aa  99  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
378 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
336 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.05 
 
 
410 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
559 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
430 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
388 aa  90.9  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
480 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.66 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
414 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
271 aa  89.7  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
231 aa  89.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
448 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  30.81 
 
 
412 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.22 
 
 
410 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
386 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  24.92 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  26.6 
 
 
406 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
420 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  30.8 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  28.77 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  23.4 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
250 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>