More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1622 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  61.8 
 
 
227 aa  296  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  57.08 
 
 
227 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  56.41 
 
 
229 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  57.69 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  55.88 
 
 
238 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  53.36 
 
 
236 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  52.3 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  52.52 
 
 
240 aa  251  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  51.07 
 
 
226 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  51.65 
 
 
238 aa  247  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  49.37 
 
 
244 aa  234  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  47.97 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 
519 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  46.38 
 
 
227 aa  212  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  44.81 
 
 
271 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  44.81 
 
 
271 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  46.81 
 
 
227 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  46.38 
 
 
227 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  42.25 
 
 
527 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  42.25 
 
 
531 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  41.86 
 
 
527 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  47.01 
 
 
230 aa  202  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 
685 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  46.58 
 
 
230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 
230 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 
234 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
235 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
235 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
227 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 
234 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
514 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.47 
 
 
410 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
411 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  29.41 
 
 
410 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
355 aa  95.5  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.74 
 
 
410 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.25 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.48 
 
 
528 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
420 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
236 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
229 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
414 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
229 aa  87  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
394 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  30.42 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
232 aa  86.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
228 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
343 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  25.71 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.05 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  28.77 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
472 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.56 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.84 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  28.51 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  25.75 
 
 
491 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  24.19 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  28.38 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1399  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.96 
 
 
236 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
480 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.7 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.15 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.7 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16771  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>