More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1399 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1399  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  100 
 
 
236 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01640  dolichol-phosphate mannosyltransferase  52.36 
 
 
239 aa  276  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  56.52 
 
 
232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  56.22 
 
 
241 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  54.62 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0554  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  52.12 
 
 
241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  55.46 
 
 
249 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  55.46 
 
 
250 aa  262  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  52.94 
 
 
248 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  52.17 
 
 
253 aa  259  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  55.79 
 
 
244 aa  259  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1573  b-glycosyltransferase  49.36 
 
 
248 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0763842  normal  0.209527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  53.36 
 
 
245 aa  258  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2691  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  52.1 
 
 
262 aa  255  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.58271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  49.59 
 
 
248 aa  255  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  52.54 
 
 
246 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.81 
 
 
239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  53.85 
 
 
242 aa  250  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  53.04 
 
 
243 aa  249  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6102  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  50 
 
 
271 aa  248  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266728  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1841  hypothetical protein  47.21 
 
 
241 aa  244  8e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  52.81 
 
 
239 aa  242  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  51.48 
 
 
246 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  52.36 
 
 
246 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  52.1 
 
 
266 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  52.19 
 
 
245 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  51.29 
 
 
251 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  51.72 
 
 
251 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_002950  PG0920  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.23 
 
 
226 aa  222  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.635493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  49.38 
 
 
261 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  49.79 
 
 
248 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  47.64 
 
 
238 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  50 
 
 
247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  46.72 
 
 
883 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  47.41 
 
 
262 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2622  glycosyl transferase family 2  44.64 
 
 
240 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  48.21 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.98 
 
 
265 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.98 
 
 
265 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.98 
 
 
265 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  45.42 
 
 
264 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2710  glycosyl transferase family 2  49.78 
 
 
249 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2624  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  50.22 
 
 
249 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.09 
 
 
248 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  43.7 
 
 
809 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  47.62 
 
 
243 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  45.96 
 
 
257 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2805  glycosyl transferase family 2  49.78 
 
 
249 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  47.35 
 
 
262 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  46.9 
 
 
262 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  47.03 
 
 
252 aa  205  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  46.43 
 
 
874 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  48 
 
 
258 aa  204  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  47.93 
 
 
262 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
246 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3418  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.98 
 
 
262 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  45.42 
 
 
263 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0422  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  44.59 
 
 
247 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1604  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  45.73 
 
 
281 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  43.1 
 
 
284 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  42.67 
 
 
252 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  47.64 
 
 
255 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
246 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  43.53 
 
 
264 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.52 
 
 
255 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  47.84 
 
 
251 aa  191  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  45.58 
 
 
272 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.85 
 
 
272 aa  188  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  41.13 
 
 
246 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  43.78 
 
 
247 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.55 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  43.42 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2704  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  45.92 
 
 
263 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  41.7 
 
 
253 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  45.49 
 
 
257 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  45.06 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  41.33 
 
 
269 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0864  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  43.18 
 
 
271 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  40.09 
 
 
233 aa  151  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1562  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  40.25 
 
 
258 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  40.36 
 
 
252 aa  145  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  37.39 
 
 
373 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  36.67 
 
 
244 aa  138  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  37.61 
 
 
236 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  35.78 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
386 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0922  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 
257 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02480  GPI anchor biosynthesis-related protein, putative  34.62 
 
 
273 aa  123  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  33.05 
 
 
388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  39.82 
 
 
864 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1357  hypothetical protein  33.05 
 
 
388 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2085  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
340 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2061  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.07 
 
 
339 aa  109  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
229 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2467  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000260943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3310  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.43 
 
 
394 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
586 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>