More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1758 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  52.05 
 
 
273 aa  234  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  48.15 
 
 
253 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
256 aa  215  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  49.12 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
262 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  44.09 
 
 
255 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  45.22 
 
 
289 aa  198  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  43.73 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  44.36 
 
 
276 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  42.65 
 
 
261 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
273 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  41.02 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.08 
 
 
780 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  43.04 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
272 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 
238 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  42.61 
 
 
380 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 
243 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  38.71 
 
 
325 aa  145  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
320 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  41.81 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
245 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  38.03 
 
 
232 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
266 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
237 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
606 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  33.49 
 
 
389 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  33.19 
 
 
574 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
613 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  29.78 
 
 
238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  30.74 
 
 
405 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
238 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  30.83 
 
 
425 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  30.63 
 
 
348 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
460 aa  111  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.51 
 
 
402 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  33.33 
 
 
435 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
241 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
378 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  33.93 
 
 
428 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
441 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
326 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
410 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
409 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
235 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
416 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
333 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
496 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
238 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
412 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
298 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
437 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
597 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
245 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
411 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
250 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
421 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
421 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
421 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
298 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
411 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
278 aa  95.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1816  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.61786  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
422 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34317  dolichol phosphate glucosyltransferase  31.8 
 
 
320 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  34.46 
 
 
332 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
432 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
254 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
227 aa  92  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
394 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
414 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  33.72 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2869  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0562178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.21 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1270  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
514 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2953  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
244 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549446  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1573  b-glycosyltransferase  30.62 
 
 
248 aa  88.6  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0763842  normal  0.209527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 
420 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.79 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.73 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 
414 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.88 
 
 
255 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.23 
 
 
240 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1783  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.99 
 
 
236 aa  86.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>