More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0960 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
316 aa  648    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  67.41 
 
 
316 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  65.51 
 
 
351 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  56.82 
 
 
531 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  55.24 
 
 
528 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  50.88 
 
 
343 aa  350  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3273  glycosyl transferase family 2  44.85 
 
 
365 aa  314  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  46.63 
 
 
351 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  48.43 
 
 
318 aa  278  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  52.69 
 
 
298 aa  272  6e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  44.73 
 
 
321 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  52.09 
 
 
311 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  44.85 
 
 
352 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
458 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0480  glycosyl transferase family 2  45.72 
 
 
410 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  47.2 
 
 
327 aa  252  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  57.54 
 
 
391 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  48.74 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2417  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 
346 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
338 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0634  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 
332 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.289574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5930  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2020  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  47.41 
 
 
153 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.44 
 
 
254 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
247 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
245 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
448 aa  99.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
227 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
230 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
230 aa  93.6  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  28.57 
 
 
250 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
237 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
227 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
229 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
232 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
229 aa  89.7  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
229 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.25 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
230 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  30.41 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
393 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
243 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
246 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
340 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
238 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  32.38 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.41 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  26.89 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  31.78 
 
 
883 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  36.06 
 
 
245 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.2 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.55 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.48 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  33.97 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  30.24 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  28.06 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  27.78 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
586 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>