More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3501 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 330 aa  681    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  58.79 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2417  glycosyl transferase family protein  57.69 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5930  glycosyl transferase family protein  59.55 
 
 		 319 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0634  glycosyl transferase family 2  53.4 
 
 		 332 aa  356  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.289574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  34.11 
 
 		 531 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3273  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.52 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.15 
 
 		 528 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  36.86 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0480  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 		 410 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  28.2 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  38.28 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.88 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 230 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 230 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 230 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 230 aa  94  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.05 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  29.56 
 
 		 243 aa  90.5  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 242 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2704  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.58 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 230 aa  89  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 232 aa  89  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 		 237 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.5 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 227 aa  85.9  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.68 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.52 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  28.38 
 
 		 874 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  28.64 
 
 		 883 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.05 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.41 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.02 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  28.69 
 
 		 749 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  28.08 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.23 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1399  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.69 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2622  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.83 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.34 
 
 		 248 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.54 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.08 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.42 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  25.86 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.33 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.6 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.36 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 685 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  28.5 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  29.32 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.83 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.72 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3114  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00091286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.35 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>