More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2243 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
264 aa  547  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  64.34 
 
 
245 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  63.52 
 
 
247 aa  341  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  63.41 
 
 
254 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  63.01 
 
 
250 aa  331  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  57.2 
 
 
247 aa  315  4e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  57.72 
 
 
246 aa  310  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  57.72 
 
 
246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  53.31 
 
 
251 aa  264  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
226 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
227 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
450 aa  99  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
313 aa  99  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.64 
 
 
528 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
448 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
316 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
227 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
316 aa  93.2  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
340 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.06 
 
 
311 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  30.39 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
352 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
327 aa  89.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
351 aa  89  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.76 
 
 
321 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
238 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.35 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.85 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  27.48 
 
 
531 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  32.68 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
246 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
233 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
298 aa  79  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  29.49 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  28.38 
 
 
310 aa  78.6  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
458 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.44 
 
 
220 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.95 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  28.75 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  28.64 
 
 
352 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.37 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  25.96 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
606 aa  73.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.43 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  30.43 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
340 aa  72  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  23.36 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>