More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0121 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  100 
 
 
250 aa  520  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  68.16 
 
 
246 aa  358  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  68.29 
 
 
245 aa  357  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  67.76 
 
 
246 aa  354  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  66.67 
 
 
247 aa  354  8.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  63.49 
 
 
254 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  63.01 
 
 
264 aa  331  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  59.67 
 
 
247 aa  319  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  51.25 
 
 
251 aa  258  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.8 
 
 
311 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
226 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
327 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  29.73 
 
 
531 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
227 aa  99  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
316 aa  98.6  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
351 aa  98.6  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
230 aa  95.5  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
458 aa  95.5  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.02 
 
 
528 aa  95.1  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
327 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
352 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
230 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
237 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
316 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
448 aa  93.2  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
343 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
355 aa  89.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
353 aa  89.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
230 aa  89  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
229 aa  89  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
293 aa  88.6  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
230 aa  88.6  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
394 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  33.94 
 
 
328 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.89 
 
 
321 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
393 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.33 
 
 
382 aa  85.5  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
313 aa  85.1  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
298 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0634  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
332 aa  82  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.289574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3273  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.67 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  30.43 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  26.14 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
246 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
385 aa  79  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.92 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30.4 
 
 
410 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  25.9 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0480  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
410 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.65 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.27 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>