More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2509 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  81.15 
 
 
247 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  81.97 
 
 
245 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  63.41 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  63.49 
 
 
250 aa  333  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  66.12 
 
 
246 aa  332  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  62.55 
 
 
247 aa  325  4.0000000000000003e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  62.5 
 
 
246 aa  319  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  51.65 
 
 
251 aa  268  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
253 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
316 aa  105  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
313 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
226 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
351 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
448 aa  101  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
355 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.03 
 
 
311 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  31.22 
 
 
531 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.17 
 
 
528 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.72 
 
 
321 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
227 aa  95.9  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
230 aa  89  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
227 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
394 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
458 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
230 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
327 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
230 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
230 aa  85.9  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.87 
 
 
241 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
227 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.52 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.77 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  28.49 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.24 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.94 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.44 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
340 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
414 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.67 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  32.48 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.64 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  31.18 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0634  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
332 aa  72  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.289574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
349 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>