More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5753 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  72.95 
 
 
246 aa  384  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  67.76 
 
 
250 aa  354  8.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  67.78 
 
 
247 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  63.64 
 
 
247 aa  333  2e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  66.11 
 
 
245 aa  332  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.5 
 
 
254 aa  319  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  57.72 
 
 
264 aa  310  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  51.49 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
230 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.12 
 
 
311 aa  98.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
316 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
220 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
351 aa  89.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.84 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
246 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
327 aa  86.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.27 
 
 
528 aa  85.9  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
336 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.86 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  25.56 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  26.22 
 
 
531 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.36 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  31.4 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.86 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
352 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
355 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
340 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.18 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2691  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.6 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.58271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  31.29 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
394 aa  72  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
230 aa  72  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
298 aa  72  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.18 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  23.44 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  21.94 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.37 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  27.91 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  25.99 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.38 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>