More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2124 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 340 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  68.59 
 
 		 328 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  53.53 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  51.75 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  53.53 
 
 		 327 aa  328  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 319 aa  325  9e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  51.14 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  52.53 
 
 		 321 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  49.52 
 
 		 385 aa  316  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  47.88 
 
 		 354 aa  308  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  49.37 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  50.32 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  49.06 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  50.64 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  49.07 
 
 		 352 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 		 253 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  26.87 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  27.1 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  30.73 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  29.63 
 
 		 531 aa  99.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  29.57 
 
 		 749 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 232 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  31.66 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 229 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 228 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 228 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.92 
 
 		 528 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.87 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 391 aa  89.4  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 244 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  27.16 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 242 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.61 
 
 		 244 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 242 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 229 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 242 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.98 
 
 		 220 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  28.91 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 242 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.99 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.02 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.46 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  38.98 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  27.6 
 
 		 883 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.24 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.73 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>