More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7628 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
306 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  99.32 
 
 
327 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  71.13 
 
 
298 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  69.49 
 
 
305 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  69.28 
 
 
309 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  73.79 
 
 
305 aa  434  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  68.58 
 
 
324 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  68.69 
 
 
298 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  70.71 
 
 
311 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  63.82 
 
 
364 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  61.82 
 
 
314 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
285 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.45 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
291 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
305 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
298 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
420 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
414 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
273 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
343 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
331 aa  95.5  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
411 aa  95.5  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
252 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
394 aa  92.8  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
394 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.93 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
340 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.72 
 
 
327 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  30.77 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
249 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
358 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.91 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  26.23 
 
 
317 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
314 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
273 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.63 
 
 
327 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.8 
 
 
327 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  26.69 
 
 
253 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
238 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
336 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
315 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 
330 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
321 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.18 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.18 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.18 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.18 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  28.64 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  28.64 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3413  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.25 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  26 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  25.67 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.28 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  26 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  26 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  26.95 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.94 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  31.8 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>