More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0245 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  73.64 
 
 		 222 aa  339  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  70.91 
 
 		 220 aa  322  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  69.55 
 
 		 220 aa  315  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 401 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  33.63 
 
 		 397 aa  135  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 		 386 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 395 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  35.07 
 
 		 389 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  37.38 
 
 		 270 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 274 aa  131  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  33.64 
 
 		 400 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  35.29 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 377 aa  124  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  41.1 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.86 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 		 344 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.35 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 		 448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 313 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 321 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  32.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 610 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 610 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32 
 
 		 305 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 572 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 340 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  36.87 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.56 
 
 		 594 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 619 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 619 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 629 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  36.72 
 
 		 299 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 347 aa  99.8  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 606 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  30.46 
 
 		 328 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.17 
 
 		 246 aa  99  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  31.63 
 
 		 352 aa  99  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 623 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 		 251 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 285 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  30.46 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 619 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  33.69 
 
 		 336 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 450 aa  97.1  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 		 536 aa  97.1  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6102  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.46 
 
 		 271 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  33.48 
 
 		 377 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.67 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  31.05 
 
 		 568 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 572 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.05 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.34 
 
 		 262 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.36 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.54 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.39 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 349 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1841  hypothetical protein  28.5 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 		 883 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 287 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.18 
 
 		 248 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.68 
 
 		 257 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.71 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 606 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 399 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.22 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>