More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001053 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  100 
 
 
333 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  55.97 
 
 
328 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  57.1 
 
 
340 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  50.62 
 
 
327 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  47.1 
 
 
385 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  49.52 
 
 
346 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  48.89 
 
 
357 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  45.78 
 
 
333 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  47.12 
 
 
357 aa  288  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 
319 aa  288  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  46.89 
 
 
352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  46.93 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  43.08 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  42.95 
 
 
354 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  43.21 
 
 
349 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  34.83 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
253 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
301 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
355 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
340 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 
353 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
303 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
287 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  30.84 
 
 
531 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  32.18 
 
 
260 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
448 aa  99.4  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
232 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  28.01 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  29.26 
 
 
749 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.68 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
347 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
228 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
228 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.55 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
293 aa  93.2  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  29.64 
 
 
299 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
336 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
685 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
228 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
298 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.75 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  25.74 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
246 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
246 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
340 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.85 
 
 
246 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
450 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
374 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 
239 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
394 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  25.99 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
262 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.46 
 
 
260 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
262 aa  85.9  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.18 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  25.7 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01640  dolichol-phosphate mannosyltransferase  24.48 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.58 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  24.75 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.42 
 
 
809 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.4 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  25.83 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
242 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
229 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.61 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.42 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.61 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.14 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>