More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0014 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  90.38 
 
 		 346 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 357 aa  720    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  70.52 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  57.41 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  50 
 
 		 328 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  51.88 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  49.37 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  48.89 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  45.29 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  46.52 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  44.1 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  45.16 
 
 		 352 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  40.06 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  38.92 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  37.88 
 
 		 253 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 		 228 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 313 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 340 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 303 aa  92.8  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  32.02 
 
 		 749 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 		 271 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.5 
 
 		 244 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 232 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 221 aa  90.1  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.36 
 
 		 310 aa  90.1  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 340 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 237 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 229 aa  88.6  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 229 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 245 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  35.53 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 394 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 245 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 448 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  33.52 
 
 		 245 aa  86.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 285 aa  86.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 230 aa  86.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 226 aa  86.3  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 246 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 299 aa  86.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 252 aa  86.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  27.39 
 
 		 531 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  26.96 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.61 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  29.95 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.88 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  28.36 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.16 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  27.24 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.55 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 229 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 228 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  32 
 
 		 260 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.21 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.09 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.95 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.1 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>