More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4518 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
346 aa  698    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  90.38 
 
 
357 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  72.62 
 
 
357 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  56.01 
 
 
349 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  50.62 
 
 
328 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  51.41 
 
 
345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  49.06 
 
 
340 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  49.52 
 
 
333 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  46.47 
 
 
385 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  44.12 
 
 
327 aa  268  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  45.19 
 
 
333 aa  264  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  44.41 
 
 
354 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  44.03 
 
 
321 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 
319 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  43.89 
 
 
352 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 
253 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
307 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
353 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
228 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
324 aa  97.1  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
336 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
293 aa  96.3  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  33.92 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
313 aa  93.2  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
245 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
245 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
245 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
237 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.88 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  32.3 
 
 
299 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.39 
 
 
310 aa  87  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
347 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.03 
 
 
749 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
340 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
221 aa  86.3  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
295 aa  86.3  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
229 aa  86.3  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
303 aa  86.3  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  27.42 
 
 
531 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
246 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
304 aa  86.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
232 aa  85.9  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
448 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
237 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
298 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  27.16 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
226 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.3 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  32.2 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.58 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  28 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.27 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.74 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.21 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.55 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.73 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  33.33 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.64 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.17 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  28.64 
 
 
243 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
228 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01640  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.03 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.47 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1604  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.56 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>