More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5930 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5930  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
319 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  77.04 
 
 
338 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  59.55 
 
 
330 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2417  glycosyl transferase family protein  57.01 
 
 
346 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0634  glycosyl transferase family 2  56.83 
 
 
332 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.289574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
316 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  39.08 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
316 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
343 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
351 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  35.93 
 
 
531 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
321 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
352 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3273  glycosyl transferase family 2  40.28 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.57 
 
 
528 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  30.94 
 
 
318 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
351 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
327 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
458 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0480  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  38.5 
 
 
257 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  39.55 
 
 
391 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
242 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  30.24 
 
 
243 aa  88.2  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
246 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.39 
 
 
248 aa  85.9  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 
239 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.96 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.79 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.88 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  28.64 
 
 
883 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2622  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2704  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.37 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.92 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.21 
 
 
809 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  28.32 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.81 
 
 
410 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.52 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  35.14 
 
 
410 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.63 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.11 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  35.14 
 
 
410 aa  75.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.5 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.73 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.31 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.27 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.48 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  28.36 
 
 
251 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.45 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  22.62 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
230 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.86 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  21.22 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  21.98 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  26.64 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.33 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  29.12 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
572 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  24.49 
 
 
874 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2691  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.24 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.58271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.82 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.5 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.94 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1841  hypothetical protein  24.5 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.32 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.92 
 
 
552 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.75 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>