More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4051 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
251 aa  520  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 
247 aa  268  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.65 
 
 
254 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  53.31 
 
 
264 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  50.63 
 
 
245 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  49.58 
 
 
247 aa  258  7e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  51.25 
 
 
250 aa  258  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  51.49 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  47.92 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 
313 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  33.2 
 
 
299 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.02 
 
 
528 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
355 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
394 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
450 aa  95.5  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
321 aa  94.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
351 aa  92  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
220 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
220 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.7 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
316 aa  88.6  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
237 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
230 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
229 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  32.33 
 
 
291 aa  86.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
378 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
298 aa  85.5  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.02 
 
 
220 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  30 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.92 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.99 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.71 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.44 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.25 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  30.81 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  28.63 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.76 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  29.95 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.61 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  28.63 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  27.62 
 
 
397 aa  75.5  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.12 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  32.73 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  29.29 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>