More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0471 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
246 aa  490  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  40.51 
 
 
247 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  43.67 
 
 
273 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 
274 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  41.74 
 
 
270 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
401 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  32.5 
 
 
400 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
395 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
377 aa  135  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  37.83 
 
 
389 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 
234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  33.02 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  39.73 
 
 
220 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
399 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.1 
 
 
220 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
386 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
572 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  33.79 
 
 
568 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
610 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
355 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
572 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
610 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
606 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
259 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
568 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
252 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  36.49 
 
 
575 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
298 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
256 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
253 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  32.58 
 
 
253 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
619 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.02 
 
 
594 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
262 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
270 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.23 
 
 
552 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
344 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
629 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
619 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
623 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
568 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
321 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
619 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  36.78 
 
 
257 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
606 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
563 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 
256 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
448 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  30.8 
 
 
563 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
268 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  33.48 
 
 
558 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
575 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
244 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
258 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
585 aa  99  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  34.85 
 
 
567 aa  98.6  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
567 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
593 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.22 
 
 
536 aa  97.8  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
450 aa  96.3  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
571 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
287 aa  96.3  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
291 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.36 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
573 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
573 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
336 aa  95.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
535 aa  94.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  35.71 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  31.58 
 
 
250 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
567 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
293 aa  92.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  31.63 
 
 
352 aa  92  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
258 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
327 aa  92  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.5 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
285 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.68 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
355 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
340 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  34.15 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  29 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
304 aa  89.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.15 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.2 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.17 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>