More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3616 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
222 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  73.64 
 
 
220 aa  339  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  69.09 
 
 
220 aa  332  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  68.78 
 
 
220 aa  327  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
395 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
401 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  34.72 
 
 
400 aa  131  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  38.43 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  36.49 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  32.74 
 
 
397 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 
386 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  37.05 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 
448 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
377 aa  117  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  34.56 
 
 
389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
313 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 
237 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 
536 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
344 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
229 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
235 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
321 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  33.93 
 
 
377 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
293 aa  99.4  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.86 
 
 
266 aa  99  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 
245 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.15 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
250 aa  95.1  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3039  methyltransferase type 12  30.74 
 
 
578 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
450 aa  94  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  27.66 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
355 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
340 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
287 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  30.88 
 
 
352 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1841  hypothetical protein  28.37 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
340 aa  91.7  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
299 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.16 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.05 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
623 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.39 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
629 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
619 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
336 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0447  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.29 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.621624  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  31.84 
 
 
291 aa  89  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
232 aa  89  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  30.77 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.41 
 
 
260 aa  88.6  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
610 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
250 aa  88.2  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
301 aa  88.2  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
295 aa  88.2  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.56 
 
 
239 aa  88.2  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.86 
 
 
305 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
619 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  31.05 
 
 
568 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
251 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.36 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
230 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.17 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
572 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  31.94 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
619 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.69 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
247 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 
399 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
239 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  36.61 
 
 
299 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
284 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
610 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
291 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
606 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>