More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2653 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  100 
 
 		 389 aa  787    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  48.94 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  33.33 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  31.18 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  36.77 
 
 		 234 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 610 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 610 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 563 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 568 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 568 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 567 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 606 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  33.62 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 		 572 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 606 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.96 
 
 		 594 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.07 
 
 		 220 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  35.74 
 
 		 568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 572 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 220 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 		 619 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 619 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 623 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 629 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 		 571 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 593 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 619 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  36.28 
 
 		 270 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 274 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  35.68 
 
 		 558 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 575 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 567 aa  133  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  33.05 
 
 		 563 aa  133  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.8 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 		 252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  36.67 
 
 		 575 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.22 
 
 		 552 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.21 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 		 573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 		 573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 259 aa  126  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 		 222 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 		 536 aa  126  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  34.91 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  31.32 
 
 		 567 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 262 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  35.89 
 
 		 273 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.53 
 
 		 535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 260 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 244 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 244 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 257 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  33.9 
 
 		 250 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 258 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 		 258 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  35.65 
 
 		 257 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  32.47 
 
 		 225 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 256 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  31.11 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  33.94 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.14 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 226 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3039  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 578 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  30.2 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 227 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 261 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 321 aa  97.1  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 228 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 237 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.68 
 
 		 244 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 233 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 291 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 246 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 248 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>