More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1105 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 245 aa  507  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  81.63 
 
 		 247 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  81.97 
 
 		 254 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  68.29 
 
 		 250 aa  357  7e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  68.57 
 
 		 246 aa  347  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  64.34 
 
 		 264 aa  342  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  66.11 
 
 		 246 aa  332  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  61.73 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  50.63 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.9 
 
 		 528 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 351 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.96 
 
 		 321 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 355 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 353 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  29.49 
 
 		 531 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 394 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 327 aa  88.6  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.19 
 
 		 311 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 313 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 336 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 298 aa  85.5  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.37 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  34.12 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 414 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.2 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.48 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.35 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 430 aa  79  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.24 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.88 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  26.24 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  28.78 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  29.44 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.73 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  31.31 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  28.82 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 391 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  24.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  29.91 
 
 		 406 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  28.38 
 
 		 410 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 385 aa  72  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>