More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0757 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20890  glycosyl transferase  50.23 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  46.61 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  47.69 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  46.19 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  45.41 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3897  glycosyl transferase family 2  46.98 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  43.24 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 		 355 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 344 aa  118  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  36 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  37.91 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 340 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 		 336 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 		 448 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 340 aa  99  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  31.18 
 
 		 352 aa  99  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 450 aa  98.6  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  35.12 
 
 		 749 aa  98.6  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  38.41 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 		 347 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  35.26 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.39 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  43.31 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  30.05 
 
 		 389 aa  92  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  34 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.28 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 353 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  36.94 
 
 		 260 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 		 243 aa  88.6  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  38.36 
 
 		 291 aa  88.2  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2691  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.84 
 
 		 262 aa  88.2  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.58271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 301 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 305 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  34.76 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.48 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.41 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.33 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 		 357 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  38.65 
 
 		 285 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 		 401 aa  85.1  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 287 aa  84.7  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.09 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  27.62 
 
 		 400 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.77 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  28.63 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.53 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  34.9 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  35.03 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.32 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>