More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3017 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  48.43 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  39.55 
 
 		 613 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  39.41 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  38.92 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  38.92 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  32.46 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  30.9 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5557  hypothetical protein  36.31 
 
 		 176 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.57 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 395 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  43.64 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  27.36 
 
 		 400 aa  85.1  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.85 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 401 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  28.76 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1841  hypothetical protein  27.78 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  28.75 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 567 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2681  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0123554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 336 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  34.13 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  28.25 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.91 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  23.15 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  29.65 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1573  b-glycosyltransferase  25.35 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0763842  normal  0.209527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0549  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.925315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1604  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.71 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.12 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2412  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1612  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.11 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0302  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1016  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.902573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.16 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.29 
 
 		 809 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.85 
 
 		 397 aa  72  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.2 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 312 aa  72  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.95 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.74 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  31.5 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2622  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.25 
 
 		 552 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20890  glycosyl transferase  32.7 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>