More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0571 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  52.47 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  49.32 
 
 
229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  47.6 
 
 
237 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  46.29 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  48.51 
 
 
238 aa  216  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  47.62 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  48.05 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 
242 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  48.67 
 
 
242 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.35 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  49.56 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 
233 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
252 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  45.65 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5557  hypothetical protein  53.22 
 
 
176 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
245 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  32.6 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
245 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2681  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
249 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0123554  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  37.95 
 
 
226 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
243 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
250 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0957  glycosyltransferase ycbB  50 
 
 
137 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00339368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
340 aa  125  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.56 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
314 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.39 
 
 
247 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
246 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
285 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.56 
 
 
241 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
291 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
311 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 
233 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
235 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.56 
 
 
245 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.42 
 
 
257 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.33 
 
 
246 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 
239 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  27.08 
 
 
264 aa  101  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.08 
 
 
248 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
353 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
336 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
262 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
311 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
313 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
229 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
246 aa  99  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
340 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.46 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.5 
 
 
265 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.5 
 
 
265 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.5 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
246 aa  95.9  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
301 aa  96.3  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.08 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
321 aa  95.5  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.06 
 
 
305 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.36 
 
 
809 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  30.46 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
344 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
355 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  27.48 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1573  b-glycosyltransferase  29.68 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0763842  normal  0.209527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  21.95 
 
 
248 aa  92  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1303  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
265 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.49 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.63 
 
 
260 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1320  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
265 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1339  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
265 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193508  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  26.41 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1357  hypothetical protein  31.25 
 
 
388 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  29.9 
 
 
749 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>