More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0602 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  62.27 
 
 
228 aa  284  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  61.7 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  57.21 
 
 
240 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20890  glycosyl transferase  48.64 
 
 
239 aa  218  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
235 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  49.77 
 
 
225 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3897  glycosyl transferase family 2  50.23 
 
 
215 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  42.06 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
230 aa  129  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
230 aa  129  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
230 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
230 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
230 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
321 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
293 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
336 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
450 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
355 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
227 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
448 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
232 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
237 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
340 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
362 aa  96.7  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  30.37 
 
 
299 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
340 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.94 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  25.47 
 
 
234 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 
243 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  36.77 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  38.35 
 
 
273 aa  86.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
285 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  33.73 
 
 
245 aa  85.5  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.14 
 
 
749 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
262 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  30.26 
 
 
389 aa  85.1  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  39.39 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  40.48 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2622  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  31.68 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  31.1 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.78 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  38.56 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.57 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
567 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
606 aa  79  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.31 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
629 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  30.1 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  30.06 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
298 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
301 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
568 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
568 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
623 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
567 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
610 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
572 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
610 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  27.32 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>